在法律能否接受计算机记录的电子会计数据（无纸化数据）作为有效的证据已是一个国际性的问题。其中，无纸化的电子会计数据能否作为审计和税务检查的有效证据，尤其是亟待解决的问题。就目前的会计电子化实务看，有关法规要求企业将计算机记录的原始数据打印到纸张上并由责任人签字，以此作为审计和其他法定需要的证据。但这种做法是计算机网络应用初期的暂时性措施，随着电子商务的不断普及，电子数据作为有效的会计证据和法律证据是必然的。
电子商务是我国商务活动中的新生事物，而电子商务条件下的会计领域则更是我国会计乃至世界会计发展的新兴领域，因而许多有关的问题，还处于不断的摸索、不断的改进、修正过程。如：有关涉及网络知识产权保护、个人隐私权保护、版权等还处于研讨阶段。现阶段，我国有关电子商务活动的法律法规还不完善，难以完全解决电子商务活动中出现的所有的新问题、新纠纷，再加上新颁布的会计法中，也未对电子商务会计处理中出现的问题做出明确规定，这就为会计人员正确记录、反映电子商务交易的及时提供准确的财务报告带来了极大的困难，同时也大大的增加了电子商务会计的不确定性、风险性。
网络经济创造了一个全新的市场，会计要发展，必须重点解决市场环境问题。市场环境有两个重点：一是物流管理服务环境，这也是网络会计处理电子单据的另一个重要来源。网络会计要发展，就必须改善物流管理环境，对商品实行统一的标准化物流管理，包括入库、质检、出库等。一是银行的资金结算服务环境，这是网络会计处理的电子单据的重要来源之一。企业与银行合作建立的结算帐户托管制和清算汇划体系等服务能否实现方便快捷、安全畅通，是网络会计发展的重要的环境制约。
传统的企业会计系统理念、理论与方法，面对电子商务的大潮显然将是苍白无力的，企业会计系统必然要转型，这就使得一种新型的会计的理念―电子商务会计应运而生。如何将电子商务会计做好。针对面临的种种问题，我们要努力做好以下四个方面：
首先，加强电子商务会计安全防范措施，建立起安全可靠的电子商务会计系统。包括以下内容：必须建成一个安全可靠的电子商务通信网络；设立防火墙、电子密钥系统；必须有权威或认证机构，由专门的验证中心验证交易双方的身份，并颁发安全证书，持有安全证书一方才有资格进入电子商务会计系统。
其次，加强电子商务立法措施，为电子商务会计发展提供一个健全的法律环境。在民法基本法的立法上，应反映出交易安全的理念。为此，要大胆借鉴和移植发达国家电子商务保护交易安全的成功经验和制度，并结合我国的实际情况，构造一套强化交易安全保护的法律制度。
再次，要大力培养全方位、复合型电子商务会计人才。
最后，发展电子商务会计市场。电子商务会计市场是电子商务会计商品进行交换的场所，也是电子商务会计发展的客观环境。完善的电子商务会计市场将对电子商务会计的发展起到重要的影响作用。
作为电子商务与传统会计的结合物，电子商务会计将会对传统会计理论框架产生了巨大的冲击，同时也蕴育着会计应用领域内一次划时代的制度变迁。中国正在由传统经济向更高级的网络信用经济发展，经济结构调整后，中国的IT产业后发优势还会发挥得更加充分，以后市场、政府、企业三种主体之间的相互配合还会变得更加密切。电子商务、电子会计模式就是这种新型市场经济关系在网络上的成功应用。
